首先在开始使用系统以前检查柱子有否微生物生长，否则柱子会堵塞，柱压会升高到无法接受的水平。然后，不接检测器，正向安装色谱柱，使用纯甲醇以0.6ml/min流速冲洗约10倍柱体积。
再连接检测器，用纯甲醇以0.6ml/min流速冲洗约20倍柱体积。
然后使用去离子水以0.6ml/min流速冲洗约20倍柱体积。
最好再确保连接好保护柱（多使用相应柱制造商针对性提供的保护柱），再用选用的洗脱液以0.6ml/min流速平衡1h以上，进样检测。同样，若洗脱液中含有缓冲盐类，在用分析洗脱液平衡之前，先用不含缓冲盐的同比例洗脱液过渡，冲洗约10倍柱体积，避免缓冲盐在分析柱内析出。
特别注意：
①洗脱液要求是新制的缓冲液。对于阳离子交换柱，多用柠檬酸或酒石酸缓冲液（或其混合溶液）、邻苯二甲酸缓冲液，pH范围从2.5到6.5；对于阴离子交换柱，多用磷酸缓冲液、硝酸铵溶液（1mMol/L），邻苯二甲酸缓冲液，pH范围从2.5到6.5。绝对禁止使用水杨酸缓冲液，因水杨酸分解产物会改变固定相的性质。洗脱液在使用以前必须用0.45um滤膜过滤并彻底脱气，以防止发生检测和泵送问题。
②提倡在室温环境使用，为了提高分析的稳定性，可以设置高于室温5～10℃的柱温，最好不要在40℃以上使用。
③使用过程中不要超过其耐受最高压力。
④增加流速或者降低流速要采取小的间隔变化以防止柱床的扰动。更换柱子，必须先降低流量至0，等待洗脱液完全流出柱子，压力变化到0（约2min）后再更换。
⑤必须防止将来自流动相或者样品中的疏水性或与流动相极性差别很大的化合物进入色谱柱，特别地，要绝对禁止导入颗粒杂质，以防止操作压力增高，污染物难以或者不能去除。
（6）分析完毕，净化程序基本同C18柱，先用去离子水以0.6ml/min流速冲洗约20倍柱体积。然后用甲醇以0.6ml/min流速冲洗约10倍柱体积，纯甲醇饱和后密封保存即可。（注意：一定要确保在柱子内没有缓冲液或者其他含盐类的洗脱液的情况下保存色谱柱。）
（7）长时间保存后重新使用，重复上述（1）～（6）即可。
② 磺酸盐型钠离子交换树脂失效如何处理
如果软化的化应该是用食盐处理，处理方法因交换器不同而不同，看你用的是哪种设备了
③ 离子交换树脂的处理方法
新购树脂常残存较多有机溶剂，低分子聚合物及有机杂质，使用前必须尽量除去，否则将影响树脂的使用寿命。
1．将树脂放在一大桶内，先用清水漂洗干净，滤干。
2．用80%~90%工业乙醇浸泡24小时，洗去树脂内的乙醇溶性有机物然后抽干（滤液供回收乙醇）。
3．用40~50℃的热水浸泡2小时，洗涤几次后，再浮选或筛选出粒度合适的树脂。目的是洗去树脂内的水溶性杂质和乙醇味。然后抽干。
4．用4倍于树脂量的2摩尔/升盐酸（1：5）溶液浸泡处理2小时（要经常翻动），目的是洗去酸溶性杂质。用蒸馏水或自来水洗至中性，抽干。
5．用4倍于树脂量的2摩尔/升（8%）氢氧化钠溶液浸泡2小时（需经常翻动），目的是洗去碱溶性杂物。用蒸馏水或自来水洗至中性，抽干，备用。
6．如果是阴离子树脂，可转型为C1型或OH型，用盐酸按上法处理一次即可；如是阳离子树脂，可转为H型或Na型，用氢氧化钠按上法处理一次即可。
再生，用过的树脂。如希望阳离子树脂为H型、Na型或NH4型，则可分别用盐酸、氢氧化钠或氢氧化铵处理；要使阴离子树脂为C1型、OH型，则可用盐酸或氢氧化钠分别处理。
树脂宜保存于阴凉处，但不宜深冻，因深冻会破坏树脂的内部结构。短期存放可置于1摩尔/升盐酸或氢氧化钠溶液中。长期存放可加入适量防腐剂封存。遇到树脂长霉，可用1%甲醛浸泡1小时后，再漂洗干净，然后进行再行处理。
详见http://power.nengyuan.net/2008/0122/20404.html