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超濾還是脫鹽柱嗎

發布時間:2024-11-04 19:15:16

Ⅰ 蛋白純化過程中,超濾能除咪唑嗎

您好!可以的,但是超濾除的不是很乾凈,用分子篩干凈些。

網路教育團隊【海納百川團】為您解答。
感謝您的採納 O(∩_∩)O 。如有疑問,歡迎追問。

Ⅱ 瓚呮護鍜孯O鍙嶆笚閫忓紡鍑姘存満鏈変粈涔堝樊寮傦紵

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Ⅲ 家用凈水器用RO還是超濾

主要看你們那自來水的水質情況。如果水質比較差,特別是水比較硬,燒水水垢多專,那就用ro反滲透,屬除雜質脫鹽,出水的問題都能解決。如果水質比較軟,燒水沒水垢,但是可能有一般雜質或者有綠藻,水比較混濁,有腥味什麼的,用超濾就可以了,脫色降濁度。
一般超濾不要電,自來水壓力就能驅動,整機價格也低。反滲透需要內置泵驅動,整機價格高。
根據需要選購才合理。

Ⅳ 微濾、超濾、納濾、反滲透有什麼區別

微濾

微濾又稱微孔過濾,是以多孔膜(微孔濾膜)為過濾介質。

在壓力推動下,截留溶液中的砂礫、淤泥、黏土等顆粒和賈第蟲、隱抱子蟲、藻類和一些細菌等,而大量溶劑、小分子及少量大分子溶質都能透過膜的分離過程。

微濾技術通過機械截留作用、物理作用或吸附截留作用、架橋作用以及網路型膜的內部截留作用去除這類物質。

微濾、超濾、納濾、反滲透比較

Ⅳ 樣本前處理(三)

蛋白提取的質量控制

我們通過上一篇筆記里介紹的各種方法把蛋白質提取出來以後,這事兒還沒完,因為我們需要對提取出來的蛋白進行一下質控,以確認是否成功提取出了足夠的蛋白,是否有污染等。

如上圖,質量控制分兩個部分:

含量測定 :檢測是否有充足的蛋白被提取出。注意上圖里提到的不兼容問題,如果你樣品里加過SDS,就不要用Bradford法來測定蛋白濃度,而可以選用BCA方法;反之,如果你樣品里加入了還原劑,就不要用BCA方法來測定蛋白,可以選用Bradford法。

SDS-PAGE :檢測蛋白的提取效率,以及是否有污染。比如我們上了50個樣,能看到的條帶卻很少,說明定量不準確。如果想從幾組樣品中尋找差異蛋白,特別需要做一次SDS-PAGE檢測同類樣品蛋白的提取效率。

以上圖為例,0號樣品中間的條帶不見了,可能是提取蛋白不充分引起的差異,也可能是樣品本身的差異。我們可以重新提取一次,先排除是否是提取造成的差異;如果是樣品本身的差異,建議用label free的方法,每個樣品單獨做定量,而不要用iTRAQ或TMT標記定量,否則會因為中間這個高豐度蛋白的影響,而導致定量不準。

我們再看來幾種常見的問題,以及解決方法,如下圖:

情況1:提取出來的結果差異很大。這種情況需要重新提取,以檢測到底是提取不充分造成的差異,還是樣品本身的差異;

情況2:左邊是分子量marker,右邊是實際樣品,可以看到實際樣品的條帶很少,可能是提取不充分,需要重設提取參數,使用更劇烈的條件,更長的時間,重新提取;

情況3:橫紋、縱紋比較多,很可能是核酸或脂蛋白的影響,這種情況需要進行脫鹽處理,也就是利用脫鹽柱與肽段結合,而與其它物質不結合,從而達到去除污染的目的。

情況4:兩個條帶很類似,但一條明顯比另一條淡。可能造成這種情況的原因有哪些呢?第一種情況,由於這是同樣類型的樣品,比如都是小鼠肌肉組織,一個樣品的蛋白質抽提充分,而另外一個樣品蛋白抽提不充分,就會導致兩條帶不一樣,這種情況下需要重新抽提。還有一種可能,考慮到是等量上樣跑的SDS-PAGE,如果兩個條帶顯示出的蛋白含量差別很大,則可能因為參考的含量測定結果不準確引起的,這時候需要重新定量。

脫鹽

蛋白提取後,還需要做脫鹽處理,我們來看看可以用哪些方法實現。

超濾: 可以截留10kDa及以上的蛋白分子,適用於體積較小的樣品。操作步驟可以是,從100μL超濾濃縮到40μL,再加緩沖液至100μL,再超濾到40μL,反復幾次。事實上,超濾是很難把污染(比如SDS)完全去掉的,最終仍然會有極少量的污染物存在,但當這些污染物的濃度降到一定程度時,則樣品的純凈度我們認為是可以接受的了。

Tips :

樣品中的尿素濃度需要控制在1M以下才能不對樣品造成影響,我們提取蛋白時使用的是8M尿素,直接稀釋8倍的話,造成樣品體積太大,下一步加入酶後,則酶和蛋白的濃度會特別低,酶解效果受到很大影響。另外,體積太大處理起來也不方便。這時也可以使用超濾的方法,多步稀釋,將尿素的濃度降到1M以下。

透析 :也是可以截留10kDa及以上的蛋白分子,適用於體積比較大的樣品,比如尿液,可以將鹽透析至外面的透析液里。

丙醇沉澱 :-20℃丙酮(V樣品:V冷丙酮=1:3以上)沉澱2個小時以上。

C18色譜柱脫鹽法 :Waters公司生產的XBridge C18色譜柱,利用柱子上的填料與蛋白結合,而鹽類物質則流穿過去,從而達到分離的目的。

還原烷基化及酶解

脫鹽完成以後,接下來我們就要進行相當重要的一步:還原烷基化及酶解。整個流程,大夥兒看下面這張圖:

這裡面有兩件事要先跟大夥兒聊聊。

首先,我們來說說為什麼步驟里要把丙酮沉澱放在烷基化以後。通過之前的學習,我們知道丙酮可以溶解樣品的去污劑、還原劑等,而蛋白是不會在丙酮中溶解的,而是會沉澱下來,這樣就達到了去除雜質的目的。

烷基化以後,球狀蛋白變成鏈狀,再通過丙酮沉澱去掉尿素或SDS等污染物,然後復溶(即重新溶解,以備下一步酶解操作),那麼鏈狀的蛋白比球狀蛋白的復溶效果會更好,可以避免因為復溶不充分而造成的損失。因此,丙酮沉澱要放在烷基化之後再做。

另外,關於酶切這一步,有些抗體如果只用胰酶進行酶切,由於酶切位點太少,導致切出來的肽段太長,不便於質譜檢測。這種情況下可以結合其它酶,比如Lys-C,進行多酶酶切,使肽段變得短一些。經過測試我們發現,用Lys-C+胰酶酶切,比只用胰酶酶切,可以提高10%-20%的鑒定率。

酶解需要在buffer體系下完成,比如25mM碳酸氫銨體系(易揮發,pH 7-8)最為常用,或者也可以使用TEAB( triethyl ammonium bicarbonate,三乙基二乙胺鹽,10-100mM)。

Tips :

如果做iTRAQ(或TMT)標記,最好用TEAB,而不是碳酸氫銨體系。因為iTRAQ(或TMT)試劑是標記末端氨基,碳酸氫銨上的氨基也會被標記上,影響蛋白的標記效率。

酶的用量可以參考以下的公式:

W(酶):W(底物)=1:20 – 1:50

此外,需要注意的是胰酶酶解的兼容性問題。胰酶只能耐受最多1M的尿素,且不能與SDS同時使用。

蛋白質及肽段的預分級

前面提過,質譜儀是一種離子飽和性儀器,高豐度蛋白的存在會對低豐度蛋白的信號產生抑制,並且質譜儀反應也需要一定的時間。例如,人的細胞內通常會表達20300種蛋白,它們酶解後,每種蛋白會產生10-20種肽段,那麼就有幾十萬種肽段,質譜很難同時檢測到這么多種肽段。所以對肽段混合物進行分級,可以降低檢測的難度,得到更多的肽段/蛋白鑒定結果。

我們既可以從蛋白水平進行分離,也可以從肽段水平進行分離,還可以將多種分離手段結合起來。從蛋白水平的分離,大家都比較熟悉吧?通常我們用SDS-PAGE或IEF等技術,利用蛋白質的分子量、形狀、等電點等理化性質的不同,將混合在一起的蛋白質分開。

第二種分離方案是在肽段水平上進行,根據肽段的不同性質,使用不同填料進行分離。

SCX(Strong Cation Exchange):是以硅膠為基質的強陽離子交換柱,可以與陽離子結合,並通過buffer進行離子交換,將陽離子分離和洗脫出來,達到與其它不帶陽離子的肽段分離的目的。

SAX(Strong Anion Exchange):硅膠鍵合季銨基團的強陰離子交換柱,可以與陰離子結合,並通過buffer進行離子交換,將陰離子分離和洗脫出來,達到與其它不帶陰離子的肽段分離的目的。

RPLC(Reverse Phase Liquid Chromatography):反相液相色譜柱,與正相柱在表面鍵合極性官能團不同,反相柱的表面鍵合的是非極性的官能團,例如,鍵合十八烷基官能團,稱為C18柱,其它常用的還有C8,C4和C2等。這里我們選用C18柱,根據肽段疏水性的不同,達到分離的目的。

HILIC(Hydrophilic interaction liquid chromatography ):親水色譜柱可以用來分離極性化合物。由於強極性肽段在反相色譜柱中保留情況都比較差,很難將它們分開,而親水色譜柱卻可以用來固定強極性的肽段,並結合高比例有機相與低比例水相組成的流動相,來實現分離的目的,且這樣的流動相組成尤其有利於提高電噴霧離子化質譜(ESI-MS)的靈敏度。

High pH - Low pH RPLC:用pH10的液相條件,結合pH2的RPLC酸性條件,進行分離。

Tips :

通常,我們通過RPLC與質譜聯用。因為RPLC體系是用水和乙腈,易揮發,不含鹽,可以直接送入質譜進行檢測。而像SCX/SAX這類正相柱,需要通過高鹽的體系將樣品洗脫下來,所以它與質譜不兼容。我們在做多級分離時,前面都會有各種鹽的洗脫,最後才是RPLC,然後就可以直接連質譜了。

多維分離:例如,先從蛋白水平進行分離,再從肽段水平進行分離,或者多種肽段水平的分級分離結合起來使用。接下來我們重點聊一下各種多維分離的策略和效果。

我們先來看看上面這張圖。左上角的「A圖「展示的是通過High pH - Low pH RPLC將樣品分成了40個餾分,然後進行叉開的合並,合並為20個餾分,這樣的合並可以讓樣品中的肽段分布更加均勻。

右上角的」B圖」展示的是通過SDS-PAGE進行分離,也分成20個餾分,然後用兩種合並方案,分別合並為5個餾分和6個餾分,這樣做的目的也是為了讓樣品的肽段分布更加均勻。

左下角的「C圖」針對同一種樣品,對High/Low pH RPLC和SDS-PAGE兩種分離策略進行了比較,發現經過兩種分離方法後,有5408個蛋白是都可以鑒定到的,另外有1951種蛋白是只在High/Low pH RPLC分離策略中鑒定到的,而用SDS-PAGE分離,則可以鑒定到其它389種蛋白。從這個圖上看,兩種方法有互補性。

右下角的四幅小圖說明,當我們在做分級分離時,分的級別越多,能鑒定到的蛋白也就越多。不過這種增長並不是呈線性關系的,分級的級數達到一定程度時,能鑒定到的蛋白數量的增長就會飽和。所以比較省時省力又能保證效果的做法時,選擇一個合適的分級數即可。

我們來看一下目前發表的文獻里,利用多級分離所能鑒定到的蛋白數量。

一篇2013年發表在MCP上的文獻報道,採用RP-RPLC兩級分離,分成常規的24個餾分,上樣量為100μg,在一天內能檢測到8000多個蛋白。

一篇2013年發表在Nat Comm上的文獻報道,先採用RP柱分級,再使用SAX分離,然後通過1米的長柱子反相色譜分離。樣品為人的胚胎幹細胞,上樣量仍然為100μg,在線分離8天檢測了9818個蛋白,如果分離時間延長到24天,則可以檢測13075個蛋白。

一篇2014年發表在Nat Method上的文獻報道,採用IEF(等電聚焦電泳,isoelectric focusing)與RPLC結合,樣品是人的上皮癌細胞,上樣量為800μg,分成了360個餾分,耗時超過15天,一共分析到13078個蛋白。

就像前面說到的,對蛋白及多肽分離的級數越多,能鑒定到的蛋白也就越多,但常常因為機時的限制,再加上這種變化趨勢到一定程度總會飽和,所以我們通常有個權衡。比如常規的分10個餾分,基本上可以鑒定到5000-8000個蛋白。如果是血清樣品,可以餾分更多一些,尤其是RPLC一維,如果分到40或60個餾分,再合並為10或20個餾分,比直接分成10個或20個餾分能鑒定到的蛋白要多30%左右!

Tips :

對於分餾分,通常是利用C18的色譜柱來分級分餾分,這個沒有試劑盒。

Ⅵ 超濾設備和抽濾機有什麼不同

理論上來是可以,但是超濾膜的孔源徑很小,所以很快就會堵塞,而且會「非常」慢。如果你想抽濾的目不是節約時間,用透析袋做透析就好了,省時省力。

如果追求分離效果,推薦你用脫鹽柱做層析。如果體積大,可以先濃縮。

Ⅶ 超濾膜一般有哪些材質,各有什麼特點

超濾膜主要有以下幾種材質:

根據的性能,超濾膜的材料可分為高分子材料和無機材料兩大類。高分子材料主要有纖維素類、聚楓類、聚醯胺類、聚烯烴、含氟類等;無機材料主要有陶瓷、金屬、玻璃、分子篩等。

1.纖維素類 :纖維素類膜材料是最早應用的超濾膜材料。主要包括:再生纖維素、二肼、聚醯亞胺、聚醚醯胺等。還有碳分子篩膜、不銹鋼醋酸纖維素、三醋酸纖維素、混合纖維素等。

2.聚烯烴類:聚烯烴類超濾膜材料主要包括聚氯乙烯、聚丙烯腈。

3.聚碸類: 聚碸類超濾膜材料主要包括聚楓、聚醚碸、磺化聚楓、聚苯碸和聚芳碸。

4.聚醯胺類: 聚醯胺類超濾膜材料主要包括聚碸醯胺、芳香族聚醯胺、芳香聚醯胺醯。

5.含氟聚合物:含氟超濾膜材料主要包括聚偏二氟乙烯、聚四氟乙烯。

6.無機材料:無機超濾膜材料主要包括陶瓷材料,如氧化鋁、氧化鋯、氧化硅、氧化鈦膜、多孔玻璃膜制備所需的碳分子篩、不銹鋼粉、多孔玻璃等材料(分相法)、溶膠-凝膠法、化學氣相沉積法等。無機膜具有優良的熱穩定性、化學穩定性和機械性能。


超濾膜分離是一種物理的分子篩分過程,所以它具有分離物無相際間變化,無質變等優點,特別適合保持風味和熱敏性物質處理。選擇超濾膜性能的優劣,主要取決於膜材料和成膜工藝條件,其中,膜材料是決定膜性能的主要參數。

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