⑴ 純化的單克隆抗體,超濾濃縮的時候會把磷酸鹽離心掉導致抗體的緩沖環境變成水嗎
不會的。。。
超濾濃縮對於緩沖液成分不會有任何改變的,因為PBS中的磷酸根離子回也好答,氯離子也好,鈉離子也好都是很小的離子,可以在溶液中自由擴散,不會因為超濾離心就被甩到下層濾液中去。
你可以做個簡單的實驗,取一定體積PBS溶液測一下pH值和電導率值,之後用超濾管去離心。取出上層未被濾完的溶液再測一下pH值和電導率值,會發現pH值和電導率值和之前測的是一樣的。即可證明未被濾完的溶液還是PBS溶液,而不是水。
⑵ 一個典型的蛋白提取液應包括哪些組份分別有什麼作用
如果是實驗室從細胞提取真核生物蛋白的話,至少需要如下組分:
SDS或者triton X-100(破細胞膜)、 磷酸鹽(緩沖液)。
用二者勻漿後,再加入硫酸銨(鹽析),便可得粗蛋白。
⑶ 蛋白質的純化實驗
一、儀器設備
色析管柱 (Pharmacia C column, 1.6×100 cm)、鐵架、鐵夾及水平儀;部分收集器(fraction collector, 需准備干凈試管約100 支);濃縮用離心機 (低速5,000 rpm);濃縮用離心管Centriprep-30 (Amicon 4322) 請注意其使用方法。
二、葯品試劑
膠體Sephacryl S-300 (Pharmacia):a. 預先以緩沖液buffer A-150 平衡好,並且使完全沈降後的膠體體積,佔全部體積的七至八成;要先預估好膠體的使用量。b. 膠體溫度要與操作場所的溫度一致,否則溫度變化會產生氣泡。c. Sephacryl 系列膠體有相當大的吸附力,因此要在緩沖液加入0.15 M 以上的NaCl 以除去非專一性吸附。Buffer A-150:注意使用時的溫度要與管柱膠體的溫度一致標準分子量組合 (Bio-Rad 151-1901):溶於1 mL 後每組取0.4 mL.含有thyroglobulin (670 kD), bovine gamma globulin (158 kD), chicken ovalbumin (44 kD), equine myoglobin (17 kD), vitamin B12 (1 350)。
三、管柱裝填
1. 以純水沖洗玻璃管柱 (以純水上下沖洗即可,嚴禁使用試管刷);並請了解管柱的構造與拆裝方法,垂直架好管柱,以軟管連接部分收集器,並以bufferA-150 試看管路是否通暢;可以用止血鉗或長尾文書夾夾住出口軟管,則可控制溶離的進行。 注意系統的擺設要適當,不要裝置於交通要沖。
2. 依預估量取出Sephacryl 膠體,注意膠體的溫度與緩沖液是否已平衡;將瓶中的膠體上下震盪,使的完全懸浮,但勿產生太多氣泡。
3. 在管柱內加入約10 cm 高緩沖液,然後將膠體慢慢沿著管壁倒入管柱,一直加到管柱頂端,開始流洗後膠體沈降很快。當膠體上方的液面逐漸降低時,可於頂端添加膠體,以達所要高度;膠體高度約90 cm。
4. 膠體完全沈降後,小心以buffer A-150 加滿管柱,關閉出口,裝上頂端端蓋並連通緩沖液瓶,打開出口以重力流洗。 調整緩沖液瓶高度,使流速約每五~六秒一滴,並設定收集體積為2.5 mL/tube。
5. 膠柱流洗約100 mL 後,關閉出口,拆開頂端端蓋,先以滴管吸出膠體上方的溶液到剩約1 cm 高,注意勿破壞膠體表面平整; 然後打開出口,使液面下降至膠體面,再關閉出口,准備注入樣本。
四、樣本色析進行
1. 以微量移液器或滴管吸取樣本 (樣本體積不得超過膠體總體積的3%),沿著膠體上方管壁緩慢加入,注意切勿破壞膠體的平整表面。
2. 打開出口,同時開啟部分收集器;當樣本完全沒入膠體時,關閉出口,緩緩加入與樣本相等體積的buffer A-150,打開出口待其慢慢進入膠體中,如此重復二次。不得擾動膠體表面,造成凹陷。
3. 暫時關閉出口,將液面高度加滿至管柱頂端,並把頂端端蓋鎖上;然後打開出口開始溶離,調整緩沖液瓶的高度,使流速為6 s 一滴。
4. 要留心觀察前面幾個分劃,確定整個系統運轉無礙,小心部分收集器最容易出問題。管柱預計將流洗過夜,收集約80 管。
10) 收集試管,進行蛋白質定量分析以及GUS 活性測定,並請作圖。
5. 收集GUS 活性區,以Centriprep-30 濃縮至10 mL 後,加buffer A-0 稀釋至20 mL,保留100 μL。
6. 管柱請再以buffer A-150 流洗100 mL 後,小心放置一旁,准備以後進行分子量測定。
五、分子量測定
1. 進行分子量測定前一天,請先以buffer A-150 流洗100 mL,並檢查膠柱內有無氣泡產生,若有嚴重的氣泡或乾裂,必須重新裝填管柱。
2. 取標準分子量溶液0.4 mL,加上純質目標酶0.5 mL (以親和層析法所得的AF 部份),如上法注入管柱中,立刻開始進行膠體過濾,並收集各分劃。請依循上述所有管柱及分劃收集器的操作要點。
3. 收集所得,進行蛋白質定量分析,可定出數個蛋白質尖峰,以作為分子量依據;另以目測法,決定紅色高峰的管數,則可定出vitamin B12的溶離管數。利用以上數據,可畫出分子量與溶離管數間的直線關系,作為分子量判定的標准校正線。
4. 同樣的一批分劃,請進行酶活性分析 (GUS),則可定出酶的溶離體積,對照上述標准校正線,則可求出酶的分子量。
六、拆除管柱及保存膠體
1. 若管柱長期不用,應當自管柱中取出膠體,以緩沖液清洗後,置冷藏室中保存,但絕對不要放在冷凍箱中。膠體若裝填太緊,有時可能不易取出,要有耐心地以緩沖液慢慢沖出來。
2. 膠體可以加0.01% NaN3防止黴菌生長,但使用前記得要洗去;再度使用時,請檢查膠體中有無灰黑色黴菌顆粒,若有結塊而不易打散者,也不要使用。